Az orosz felszabadító csapatok 1945 nagyhetén érkeztek megy Győrbe, ezért Apor Vilmos püspök a nagyheti szertartásokat már az óvóhelyen, a menekültek társaságában tartotta meg.
A nagypénteki szentmisét azonban megzavarták: orosz katonák érkeztek a Püspökvár pincéjébe, mondván, hogy a püspök adjon a szolgálatukba 90-100 fiatalasszonyt „krumpli pucolás céljából”. Egy fiatal lány ijedtében előbújt rejtekhelyéből és futni kezdett . A katonák utána szaladtak, de a püspök eléjük lépett és kitárt karral tolta kifelé őket a lépcsőn, mutatva a kifelé vezető utat. Ekkor az egyik katona lerántotta a válláról gépfegyverét, s négy megfélemlítő lövést adott le, melynek nyomai ma is látszanak a plafonon. Ez felbátorította a másik katonát, aki rálőtt a püspökre.
Az első lövés a karján érte, de csak a szemüvegtokját találta el, a második lövés a szemöldöke felett a homlokát súrolta, a harmadik pedig a köldöke felett a hasát érte. Apor Vilmost hordágyon, az éj leple alatt a városi kórházba viszik, ahol Petz Aladár közreműködésével megműtik. Ám a harmadik, a hasát ért golyót nem tudták eltávolítani. Ebbe a lövésbe halt bele 3 nap múlva.
